自古以來，人們把瑪瑙和珍珠并列為珍寶一類，但現今的瑪瑙，因其產量大而普遍使用，又因其生產遍布世界各地，所以價值并不高，屬低檔材質的飾物和玉雕工藝品，在珠寶市場上的價格也相對較低。
（一）按照顏色劃分：
1.紅瑪瑙：紅色的瑪瑙，即古代的赤玉。紅瑪瑙是各色瑪瑙中的上品，故在《格古要論》中有“瑪瑙無紅一世窮”之說。
2.藍瑪瑙：指藍色或藍白相間的瑪瑙。這是一種顏色十分美麗的瑪瑙，瑰度大者是玉雕的好原料。優質者顏色深藍，次者顏色淺淡。
3.紫瑪瑙：紫色瑪瑙。多呈單一的紫色，優質者顏色如同紫晶，而且光亮。次者色淡，或者不夠光亮，俗稱“悶”。
4.綠瑪瑙：綠色的瑪瑙。自然界不見綠瑪瑙，目前中國珠寶市場上的綠瑪瑙幾乎都是人工著色而成，其色濃綠，有的色似翡翠。綠瑪瑙顏色“單薄”，質地無翠性，性脆。
5.黑瑪瑙：黑色的瑪瑙。自然界少見黑瑪瑙，目前中國珠寶市場上的黑瑪瑙都是人工著色而成，其色濃黑，易與其它黑色玉石相混。以其硬度大于黑耀石等區別。
6.白瑪瑙：以白色調為主或無色的瑪瑙，其實有的屬于白玉髓，多用于制作珠子，然后進行人工著色，可以著色成藍，綠，黑等色。
7.其它顏色的瑪瑙：除上述各色瑪瑙外，其它顏色的瑪瑙，均可按不同顏色加以命名。
（二）按照紋理構造劃分：
1.纏絲瑪瑙：具有細紋帶構造的瑪瑙，亦稱“縞瑪瑙”。有時細紋帶可細得像蠶絲一樣，而且顏色有許多種變化，可進一步劃分出以下纏絲瑪瑙中的品種：縞瑪瑙，紅縞瑪瑙，紅白縞瑪瑙，黑白縞瑪瑙，褐白縞瑪瑙，棕黑縞瑪瑙。
2.帶狀瑪瑙：紋帶較寬的瑪瑙。呈單色出現者，即前述的紅瑪瑙，藍瑪瑙之類。然而，無色的帶狀瑪瑙不一定都能進行人工著色。當前，在中國珠寶界一般不采用帶狀瑪瑙進行人工著色，而喜歡選用無紋帶的，實際上是玉髓內的原料來進行這這種染色。
（三）按質地或其它特性劃分：
1.透明瑪瑙：透明如水的瑪瑙。在所有品種的瑪瑙中，透明度越高質量越佳。完全透明如水的瑪瑙比較罕見，通常半透明者就是佳口。
2.不透明瑪瑙：光線透不過瑪瑙的稱為不透明瑪瑙。
3.半透明瑪瑙：介于1和2之間的瑪瑙。這一品種在瑪瑙中最為常見，但不應將半透明者稱為透明者。
4.城棱瑪瑙：在纏絲瑪瑙或帶狀瑪瑙中，如果出現形似“城廓”的棱角狀構造，則稱為城棱瑪瑙。
5.苔蘚瑪瑙：當瑪瑙中混入綠泥石礦物時，有時形成苔蘚狀或樹枝狀花紋，則稱苔蘚瑪瑙。
6.云瑪瑙：質地有云霧感的瑪瑙。
7.火瑪瑙：這是一種在瑪瑙條帶中含有氧化鐵板狀晶體的瑪瑙，因所含礦物在陽光下閃灼火紅的光澤，故而取名火瑪瑙。
8.閃光瑪瑙：由瑪瑙條帶相互干擾出現許多條黑色或暗色條帶的瑪瑙。
9.水膽瑪瑙：瑪瑙中包含有天然液體的品種。液體通常包裹在球狀瑪瑙的中心，因形態常似動物的膽囊，故而得名。
中國自古以來，對瑪瑙的品種劃分得很細，除上述品種外，尚有基底上有錦花的“錦江瑪瑙”，漆黑基底上有一線白的“合子瑪瑙”，兩次成因的“子孫瑪瑙”，有淡色水花的“漿水瑪瑙”，有紫色花斑的“醬斑瑪瑙”，有竹葉狀花紋的“竹葉瑪瑙”，有蚯蚓狀粉花的“曲蟮瑪瑙”等等。不過，這些品種和名稱，在現今一般很少用，多見于史籍之中。